TABLE 1

Primers used for chimera construction

List of primers used to design the chimeras analyzed in this study.

Chimera NumberForward PrimerReverse Primer
1 Insert5′-ACGCTCGGTGCACTGGCACAGGAAGGCACCCAA-3′5′-TGCAGTCGACGGTACCATGCCCATCCGGATCTTCTGCTC-3′
1 Backbone5′-TGCACCGAGCGTGTGCAGTACTA-3′5′-GGTACCGTCGACTGCAGAATTCG-3′
2 Insert5′-TTGAGATTGCACAGGGTGACTG CTGGGAAAGTGAGCT-3′5′-TGCAGTCGACGGTACCATGCCCATCCGGATCTTCTGCTC-3′
2 Backbone5′-CTGTGCAATCTCAATGAGTTCCGCTT-3′5′-GGTACCGTCGACTGCAGAATTCG-3′
3 Insert5′-GAGCTGCTGGCCCGGCCAGGTACAGCAAGTCAGGGTA-3′5′-TGCAGTCGACGGTACCATGCCCATCCGGATCTTCTGCTC-3′
3 Backbone5′-GAGCTGCTGGCCCTGCTCAACAA-3′5′-GGTACCGTCGACTGCAGAATTCG-3′
4 Insert5′-CAATATCTCCAGCTGTCTTGCTCCACCTGGGCCAGAG-3′5′-TGCAGTCGACGGTACCATGCCCATCCGGATCTTCTGCTC-3′
4 Backbone5′-CAGCTGGAGATATTGCAGGACAA-3′5′-GGTACCGTCGACTGCAGAATTCG-3′
5 Insert5′-ATAGAATTCACGCATAATCGCTCCTGCCACCGACTG-3′5′-TGCAGTCGACGGTACCATGCCCATCCGGATCTTCTGCTC-3′
5 Backbone5′-ATGCGTGAATTCTATGACCGTGCA-3′5′-GGTACCGTCGACTGCAGAATTCG-3′
5-N Insert5′-TGCGGCCGCCACCATGATCCGGCGCTGCAGGGGCCA-3′5′-AAGGCCACTGCCCAAAGCGCCCGTCGCTGGAAAGAGCCT-3′
5-N Backbone5′-CATGGTGGCGGCCGCAGATATCGAT-3′5′-CTTTGGGCAGTGGCCTTCGTCGGAT-3′
6 Insert5′-TATTTTGTAAACACTGTGGTGAAGTCTTGATGCCCACACT-3′5′-CTGCAGGGGCCAATGGACCTCAAGGAGAGCCCCAGT-3′
6 Backbone5′-GTGTTTACAAAATACGGGAAGTGTTACAT-3′5′-TGGCCCCTGCAGCGCCGGAT-3′
7 Insert5′-AGGGACGTGCAGAAGGCGATGGTCAGCGGCCCATACACGAA-3′5′-GGGGAACGGCAGCACCTTGGTAACATGCTGATAAGA-3′
7 Backbone5′-GCCTTCTGCACGTCCCTCGGCTT-3′5′-GGACCAGGACAGCAGCAAGCCGA-3′
8 Insert5′-TCGGCTTGCTGCTGTCCTGGTCCTCGGAGAGGGTGTCCTACTAT-3′5′-ACAGCAGCAAGCCGAGGGACGTGCAGAAGGCCAGCACCCA-3′
8 Backbone5′-CGCCGCTCCGGTCTCCTCCGG-3′5′-CTGCCGTTCCCCGCCGTCA-3′
9 Insert5′-TGCGGAACCACTGGCGGTCTGCCAGATGCGGGTCGGGAA-3′5′-TATCCTCCAGCTGGTGGCCTACCCGGTGCAGGAACTCCA-3′
9 Backbone5′-CGCCAGTGGTTCCGCAAACT-3′5′-CACCAGCTGGAGGATATGCTGCT-3′
105′-TCTCTTATCAGCATGTTACCAAGGTGGATGAAGTGGTGCGCCAGCTGCCGTTCCCCG-3′5′-ATGCTGATAAGAGAAATAGTAGGACACCCTCTCCGAGCTCTCCACCAGCAGCAGGCCCA-3′
10-15′-CTGGGAAGACCAGGCTCTGGGCCACCACTTCATCCACCTTGGTAA-3′5′-CCTGGTCTTCCCAGCTGTGACCTGCAACAACAACCCCCTGCGCTT-3′
10-25′-GATGCGGGTCGGGAATCTGTAGGCGGTTGGGAAGCAGCAGCCCTA-3′5′-TCCCGACCCGCATCTGGCAGACCCCACGGTGCTGGAGGCC-3′
115′-TCGAGGGCATCAGCGCTGCCTTCATGGACCGTTTGGGCCACCAGCTGGAGGATATGCTGCT-3′5′-AGCGCTGATGCCCTCGAAGTGGCGCGGCGGCAGGAAGAGGCGCTTCTGTCGGAGGGCCTCCAGCA-3′
11-15′-ATTGAGGTTGCAGAGGGTCACAGCTGGGAAGACCAGGCT-3′5′-CTCTGCAACCTCAATCTGCGCTTCCCGCGCCTCTCC-3′
11-25′-GGAAGCCATTGAGGTTGCAGAGGGTCACAGCTGGGAAGACCAGGCTCT-3′5′-CCTCAATGGCTTCCGGTTCTCCCTCTCCAAGGGGGACCTCTACTA-3′
11-35′-CCAGCAGGGCCAGCAACTCCCCGCCCGCGTAGTAGAGGTCCCCCTT-3′5′-GCTGGCCCTGCTGGATGTCAACCTACAGATTCCCGACCCGCATCT-3′
11-45′-TAGTAGAGGTCCCCCTTGGAGAGGGAGAACCGGAAGCCATTGAGGTT-3′5′-AGGGGGACCTCTACTACGCGGGCGGGGAGTTGCTGGCCCTGCT-3′
11-55′-AAGGGGGACGACTTGTACCACGCTGGGGAGTTGCTGGCCCTGCTGGAT-3′5′-TGGTACAAGTCGTCCCCCTTGGAGAGGGAGAACCGGAAGCCATTGAGGTT-3′
11-65′-ACCACCAACCTCTACTACGCGGGCGGGGAGTTGCTGGCCCTGCTGGAT-3′5′-TAGTAGAGGTTGGTGGTAAGCCTGGAGAACCGGAAGCCATTGAGGTT-3′